迄今全球没有哪一家冷藏集装箱运输服务经营人或者集装箱班轮公司有能力完全确保整个鲜活货物的冷链周期的质量，原因不外乎是缺乏:全球冷链集装箱运输共同操作规程;跟踪系统;信息沟通标准;检测标准;包括仓储和物流在内的承运人的透明;冷藏链集装箱运输基础设施投资开发和专业人员培训和团队精神发挥等等。
此外还有冷链技术方面的问题，例如冷藏集装箱温度特定维护不是一天两天的事情，而且根据货物鲜活特性不同而温度控制水平各有不同，因此与冷藏机器性能和工作人员技能素质关系密切的冷链温度维护技术规范复杂，而冷藏集装箱温度管理操作是否到位直接影响到箱内冷藏货物能否保质保量抵达目的地货主手中。
冷链服务要求高
值得冷链集装箱运输市场业内人士高度关注的是，由于全球冷链距离远，时间长，还要转运和多式联运，插手的不同承运人特别多，其中主要是卡车、火车、航空和远洋承运人，而偏偏与冷链集装箱运输有关的承运人相互之间缺乏信息沟通，犹如铁路警察各管一段。更加令人吃惊的是，日本是迄今世界上冷藏货物航空进口量最大的国家，日本的投资开发财力和技术骨干力量十分可观，偏偏在日本东京和全国各地主要国际机场没有一座像样的冷藏仓库，一旦遇到航空班机时间表延误，等候在机场准备空运或者已经卸下准备卡车转运的冷藏产品的质量难以得到安全保障。不少冷链市场专家们指出，确保全程冷链服务质量的关键是必须百分之百控制供应链，例如需要冷链服务的蔬菜、水果、鲜花、食品、冷饮，牛奶，乳制品，猪羊牛肉，鱼虾等等必须从田头、牛奶棚和捕鱼船等生产始发现场开始进行货物和冷藏集装箱的预冷，再严格按照规定进行冷藏集装箱装运操作，直至目的地。
冷藏集装箱卡车
当前全球冷链集装箱运输质量面临的挑战从本质上讲，其实就是承运人和托运人必须携手团结、相互合作、共同承担责任;冷藏集装箱承运人是否尽力尽责，在很大程度上讲，有赖于托运人能否及时、精确和全面提供有关冷藏集装箱货物信息资料，凡是希望自己的货物能够安全、保质和保量地送达收货人之手的任何冷藏货物的货主或者托运人，必须想方设法地在冷链集装箱运输全过程中的每一个环节或阶段与相关承运人和操作人员保持信息沟通;例如有些冷藏集装箱在码头堆场耽搁时间过长，超过免费停放期限，超期停放在集装箱码头的冷冻集装箱所支付的费用低于冷库储藏冻货，似乎有利于托运人，如此却可能造成集装箱码头拥塞和承运人集装箱设备调运，这个时候应该通过信息沟通，以经济利弊为驱动力，促使托运人、货主或者码头经营人等责任方尽快发运耽搁在码头的冷冻箱;当然有时候冷藏耽搁在码头是由于承运人和码头经营人责任造成的，必须时刻关心和跟踪其冷冻集装箱动态的托运人获悉后，必须立即通知责任方迅速调运冷箱，避免因为不适当耽搁时间而产生冷链经济损失。
运力严重不足
当前全球冷链面临的最大挑战其实是全球冷藏集装箱缺口和冷藏集装箱运力不足，这是托运人感到最头痛的事情，即冷链货物没有足够的集装箱装运，或者一大批冷冻集装箱找不到适当的货轮和集装箱卡车装运等等;2008年夏季前在英国伦敦举办的全球冷冻货物流大会和全球冷链物流大会两个会议指出，随着全球海产品、冷冻食品和新鲜蔬果进出贸易量不断增长，现在全球冷冻集装箱设备和冷冻散货运输船运力均出现不足，其缺口正逐渐扩大;从1997年到2007年整整十年间，全球需要温度控制食品运量增长51%，其中绝大多数是新鲜水果和蔬菜，其次是新鲜鱼、乳品和肉，但是在同一期间全球冷藏集装箱设备和冷藏船运力增长仅仅10%，供需两者相距甚远。尽管集装箱船队运力增长迅速，其中仍然有相当一部分集装箱船队因为设备陈旧，因为没有适当的冷藏箱电源插座，或者船舶原来设计技术规范限制而无法承运冷藏集装箱，而正在迅速增加新船的冷藏船队运力迄今也严重不足。
目前远洋承运人决定直接扩大投资，或者通过收购兼并地方冷链公司等手段，增加冷链集装箱设备运力，不断引进信息科学技术设施，不断优化全球冷链集装箱运输质量、效率和效益，从根本上铲除目前仍然十分严峻的全球冷链集装箱运输经营管理结构缺陷。据了解，当前中国独缺标准化冷链战略，从战略角度看，中国冷链信息管理机制还处于初级阶段，而其冷链市场空间之大却是举世一流。而位居世界第二大水果和蔬菜生产大国的印度冷链集装箱运输行业更加落后于中国，由于严重缺乏冷链集装箱运输能力，印度水果和蔬菜出口贸易受到严重延误，由于国内无法充分消费产量如此高的水果蔬菜，印度目前国内水果蔬菜总产量约30%被浪费掉。于是法国达飞（CMA CGM）中国收购兼并Cheng Lie Navigation支线公司，进一步扩大法国达飞航运公司在泛亚市场所占的份额;中国香港东方海外集装箱班轮公司（OOCL）也在中国大陆扩大投资，建设更多的冷链仓库和添增冷藏集装箱卡车。而印度有越来越多的批发零售商自己贷款融资扩大投资，添置冷藏集装箱卡车和储运冷库，把印度水果和蔬菜出口到非洲、中东和远东地区，希望从中获得一大笔收益。而一些冷链专家指出，印度人自己搞冷链所产生的成本很高。
企业与组织：
